黄连素对目前畜禽兽医临床常见的多种致病菌，如大肠杆菌、魏氏梭菌、沙门氏菌、巴氏杆菌、痢疾杆菌、链球菌和葡萄球菌等均有较好的抑制作用。所以说，它对当前畜禽兽医临床上长期以来比较难治的细菌性痢疾、腹泻、胃炎和肠炎等具有很好的治疗效果。
她的独特作用机制，对用于治疗畜禽因食入细菌性病原、变换饲料、热应激等多种因素导致的肠炎、肠毒综合征，对其症状的改善和治疗具有显著的应用效果。
比如研究发现：有一些细菌性胃肠道泄泻，造成炎症和症状的不是细菌本身，而是这些病原菌产生的肠毒素，它们影响了肠黏膜上皮细胞上的一种酶，使肠道分泌物增加，表现为剧烈泄泻。
而这个时候，人们往往单用或联用几种抗生素进行治疗，使用的治疗要么无效、要么效果不佳；此时若复配口服黄连素，则可收到比较满意的治疗效果。这是因为黄连素不仅可抗菌，还能抑制这种酶。
再比如说黄连素对幽门螺杆菌(Hp)作用，它不仅对其有一定的杀灭作用，而且还对胃肠黏膜有一定的保护作用。它的这种作用机理，使得它在与其他抗幽门螺杆菌的抗菌素联合使用时，能收到更满意的治疗效果。
因此，在治疗鸡腺肌胃炎、畜禽泄泻、肠毒综合征等消化道疾病时，用好黄连素将会收到事半功倍的效果。比如说，使用“30%阿莫西林可溶性粉+黄连素”或“32.5%硫酸新霉素可溶性粉+黄连素”的处方，治疗上述畜禽的急性、难治性胃肠道疾病。
当然，在上述处方中，复配的比例、用药的剂量和给药的方法，直接关乎处方的有效性、适口性、经济价值等处方的技术水准指标。所以，还需要实际养殖生产中，针对不同的靶动物、不同的日龄、不同的疾病状况等技术性施用。
硫酸黄连素
药理药效
本品为中药提纯精制广谱长效抗菌药物。对多种革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌均有抑制作用，对溶血性链球菌、痢疾杆菌、沙门氏菌、伤寒杆菌、巴氏杆菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、弗氏、志贺氏痢疾杆菌等均有抗菌作用，并有增强白血球吞噬作用，对结核杆菌、鼠疫菌也有不同程度的抑制作用，还具有退热作用及抗心率失常作用。主用于细菌病毒引起的肠道感染，各种急慢性胃肠炎、流行性腹泻、久泻不止、恶性腹泻、梭菌性肠炎、季节性拉稀，各种化脓性感染症。
硫酸黄连素能抑制细菌糖代谢中丙酮酸的氧化过程，影响细菌对维生素B6,烟酰胺等的利用，一抑制细菌DNA、RNA、蛋白质及类脂的合成，还可与DNA形成复合物，影响DNA的复制，干扰细菌繁殖。此外，还能增强白细胞吞噬金黄色葡萄球菌的能力，增强网妆内皮系统的吞噬能力，对细菌毒素还有明显的解毒效应，属免役增强剂。与肠内的产生吲哚、甲基吲哚等有害物质的酶相拮抗，抑制肠内的腐败发酵。促进猫狗肝脏胆汁的生成和分泌作用。
硫酸黄连素内服可吸收，吸收后可迅速进入心、肺、肝、肾等组织中，故血中浓度较低。在体内经大部分肝脏代谢后由肾排出，仅少部分以原形由尿排出。
硫酸黄连素在体外及体内均有抗阿米巴原虫作用,体外效力相当于依米丁的1/及汉防已及汉防已甲素的1/4,体内效力相当于汉防已甲素的1/16。
硫酸小檗碱0.1-6.0mg/kg静脉注射，可使麻醉犬、猫、大鼠血压下降。
硫酸小檗碱1-3mg/ml体外试验，可降低肝素(50u/ml)对人及犬血的抗凝血作用，但小檗碱单独使用10mg/ml，本身具抗凝作用。
因人体内有大量的氯离子，但没有硫酸根离子，盐酸小檗碱中的氯离子对人体是正常的，而硫酸小檗碱中的硫酸根却对人体有害,所以硫酸小檗碱只能一般用来做兽药。
用途
1、敏感菌和密螺旋体感染引起的畜禽、仔猪红痢、黄痢、白痢、肠炎、水肿病、副伤寒等。
2、猪传染性胃肠炎,流行性腹泻,久泻不止、恶性腹泻、梭菌性肠炎、季节性拉稀、剧烈水样腹泻,呕吐,粪便含未消化的凝乳块,腥臭,严重脱水,被毛粗乱消瘦，顽固性、耐药性大肠杆菌、肠毒湿热引发的腹泻、拉稀、粪便呈灰白色、紫黑色、发腥、恶臭等。
3、治疗各种家畜菌毒感染引起的食欲减退或不吃，顽固性、耐药性重度下痢，特别对仔猪黄、白、红痢有特效。
4、犊牛、幼驹、羔羊、仔猪、犬、猫、兔、鹿的各种痢疾,水泻,冬季性腹泻等.亦用于副伤寒引起的下痢,呼吸困难,皮肤紫色斑点，不明原因泻痢等症。对溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌、霍乱弧菌、脑膜炎球菌、伤寒杆菌等有较强的抑制作用，对流感病毒、阿米巴原虫、钩端螺旋体、某些皮肤真菌也有一定的抑制作用。
5、猪乳腺炎、子宫炎、急性胃肠炎、细菌性肠炎等。
用法与用量
肌内或静脉注射一次量每1Kg体重马、牛0.15,0.05g(相当于本品0.,0.4ml)
羊、猪0.05,0.1g(相当于本品0.05,0.1ml)
鸡、鸭0.,0.05g(相当于本品0.,0.05ml)
一日2次连用1~2日，功效清热燥湿，泻炎解毒。